در کنار اجرای طرح های مددکاری و حمایتی، بنیاد نسبت به ایجاد اشتغال پایدار برای ساکنین روستاهای هدف و به­خصوص جوانان اهتمام ویژه دارد. نبود آب و خاک مناسب و نیز اقلیم گرم و خشک مناطق هدف بنیاد، به‌ویژه شهرستان بشاگرد، باعث می‌شود بسیاری از فرصت‌های شغلی، که به‌طور معمول در سایر روستاهای کشور وجود دارد، در این مناطق امکان اجرا نداشته باشند. ازاین‌رو روستاییان ناچار به دنبال اشتغال در حوزۀ خدمات هستند که در این بخش نیز به‌دلیل کمبود سرمایه به‌ندرت می‌توانند بدون حمایت نهادهای امدادی کسب و کار راه بیندازند.
بنیاد خیریۀ خواجه نصیر طوسی از ابتدای شروع فعالیت‌های خود در این مناطق بر ایجاد منابع درآمد پایدار برای روستاییان تمرکز داشته است.  اقدامات بنیاد در این حوزه عبارت است از: